Com o uso prolongado do computador, os dados nele ficam fragmentados. A desfragmentação corrige essa deficiência, ajuda a melhorar o desempenho do computador e prolonga a vida útil das unidades.
Se um usuário fizer grandes alterações em um arquivo em uso, o espaço em disco alocado para ele pode não ser suficiente. Em seguida, os dados são gravados em blocos. Uma situação semelhante ocorre ao gravar arquivos grandes em um disco quase cheio. Quando há pouco espaço vazio no disco, todos os novos dados são gravados nele em qualquer espaço livre. Os arquivos parecem estar rasgados em vários pedaços localizados em diferentes partes do disco. Se os processos de apagamento e gravação de dados ocorrerem com freqüência suficiente, a maior parte do disco ficará fragmentada. Isso reduz significativamente o desempenho do sistema operacional, o tempo de acesso aos arquivos e os tempos de inicialização do programa. Todas essas consequências desagradáveis podem ser evitadas executando o processo de desfragmentação do disco. Com isso, o arquivo é reunido em um todo, os dados são salvos no início do disco e o espaço livre permanece no final, o que também aumenta a velocidade de acesso aos arquivos e pastas. Com a desfragmentação regular, a vida útil do disco aumentará, pois o cabeçote de leitura faz significativamente menos movimentos. Você pode desfragmentar usando programas especiais. O sistema operacional geralmente possui um programa embutido para este processo. Para utilizá-lo, na janela "Meu Computador" clique com o botão direito do mouse no disco que deseja desfragmentar e no menu "Ferramentas" selecione "realizar desfragmentação". Em seguida, você verá a janela do programa, onde pode selecionar primeiro a análise do disco quanto ao grau de fragmentação e, em seguida, executar as ações necessárias. Existem muitos programas comerciais de desfragmentação disponíveis. Eles executam o processo de forma mais completa, é possível executar o processo em segundo plano e em uma programação especificada. Mas, para o usuário médio, o programa de desfragmentação embutido costuma ser suficiente.